MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021030	ATC	2	6	22113	22118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185175
502	NC_021030	TGC	2	6	22203	22208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185175
503	NC_021030	AGC	2	6	22221	22226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185175
504	NC_021030	CCG	2	6	22235	22240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185175
505	NC_021030	GGGAAC	2	12	22302	22313	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479185175
506	NC_021030	CGT	2	6	22384	22389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185175
507	NC_021030	CGG	3	9	22393	22401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185175
508	NC_021030	CGAC	2	8	22417	22424	25 %	0 %	25 %	50 %	479185175
509	NC_021030	AGG	2	6	22425	22430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185175
510	NC_021030	GTT	2	6	22443	22448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185175
511	NC_021030	TTCG	2	8	22467	22474	0 %	50 %	25 %	25 %	479185176
512	NC_021030	GTA	2	6	22539	22544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
513	NC_021030	CGT	2	6	22559	22564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
514	NC_021030	GTT	2	6	22608	22613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185176
515	NC_021030	CTGG	2	8	22614	22621	0 %	25 %	50 %	25 %	479185176
516	NC_021030	T	6	6	22638	22643	0 %	100 %	0 %	0 %	479185176
517	NC_021030	CGGT	2	8	22679	22686	0 %	25 %	50 %	25 %	479185176
518	NC_021030	GCC	2	6	22720	22725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
519	NC_021030	TTG	2	6	22726	22731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185176
520	NC_021030	CAC	2	6	22755	22760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185176
521	NC_021030	TGA	2	6	22865	22870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
522	NC_021030	CGGCC	2	10	22883	22892	0 %	0 %	40 %	60 %	479185176
523	NC_021030	CGT	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
524	NC_021030	GTT	2	6	22941	22946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185176
525	NC_021030	CGG	2	6	23057	23062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185176
526	NC_021030	CGT	2	6	23081	23086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
527	NC_021030	ACGA	2	8	23089	23096	50 %	0 %	25 %	25 %	479185176
528	NC_021030	CGCC	2	8	23127	23134	0 %	0 %	25 %	75 %	479185176
529	NC_021030	TGTCGG	2	12	23156	23167	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479185176
530	NC_021030	CAC	2	6	23193	23198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185176
531	NC_021030	TCC	2	6	23230	23235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185176
532	NC_021030	AGG	2	6	23309	23314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185176
533	NC_021030	CGT	2	6	23324	23329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
534	NC_021030	TCA	2	6	23336	23341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185176
535	NC_021030	CAG	2	6	23352	23357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185176
536	NC_021030	GCG	2	6	23393	23398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185176
537	NC_021030	GC	3	6	23417	23422	0 %	0 %	50 %	50 %	479185176
538	NC_021030	AGT	2	6	23429	23434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
539	NC_021030	CGC	2	6	23541	23546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
540	NC_021030	ATG	2	6	23551	23556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
541	NC_021030	GTAGCC	2	12	23583	23594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479185176
542	NC_021030	GAT	2	6	23664	23669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
543	NC_021030	CG	3	6	23674	23679	0 %	0 %	50 %	50 %	479185176
544	NC_021030	GCC	2	6	23710	23715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
545	NC_021030	ACC	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185176
546	NC_021030	CCG	2	6	23725	23730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
547	NC_021030	GC	3	6	23792	23797	0 %	0 %	50 %	50 %	479185176
548	NC_021030	CTT	2	6	23835	23840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185176
549	NC_021030	CGTCG	2	10	23841	23850	0 %	20 %	40 %	40 %	479185176
550	NC_021030	TCC	2	6	23992	23997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185176
551	NC_021030	GAT	2	6	24027	24032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
552	NC_021030	GCC	2	6	24040	24045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
553	NC_021030	CAG	2	6	24060	24065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185176
554	NC_021030	ATG	2	6	24127	24132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
555	NC_021030	TTC	2	6	24145	24150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185176
556	NC_021030	CGG	2	6	24167	24172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185176
557	NC_021030	CGT	2	6	24197	24202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
558	NC_021030	ATG	2	6	24211	24216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185176
559	NC_021030	GCC	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
560	NC_021030	CGGAC	2	10	24258	24267	20 %	0 %	40 %	40 %	479185176
561	NC_021030	GCT	2	6	24269	24274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
562	NC_021030	CCG	4	12	24277	24288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
563	NC_021030	CCG	2	6	24292	24297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
564	NC_021030	GTC	2	6	24333	24338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185176
565	NC_021030	GCC	2	6	24361	24366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185176
566	NC_021030	CGA	2	6	24368	24373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185176
567	NC_021030	T	6	6	24384	24389	0 %	100 %	0 %	0 %	479185176
568	NC_021030	T	6	6	24412	24417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021030	CTC	2	6	24457	24462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_021030	TGCA	2	8	24495	24502	25 %	25 %	25 %	25 %	479185177
571	NC_021030	GCCG	2	8	24515	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	479185177
572	NC_021030	GCC	3	9	24527	24535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185177
573	NC_021030	GTA	2	6	24563	24568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185177
574	NC_021030	GTT	3	9	24647	24655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185177
575	NC_021030	CGA	2	6	24668	24673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185177
576	NC_021030	CGT	2	6	24718	24723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185177
577	NC_021030	ATC	2	6	24732	24737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185177
578	NC_021030	GTT	2	6	24749	24754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185177
579	NC_021030	CGT	2	6	24766	24771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185177
580	NC_021030	CCT	2	6	24787	24792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185177
581	NC_021030	CCA	2	6	24811	24816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185177
582	NC_021030	CCG	2	6	24877	24882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185177
583	NC_021030	GTC	2	6	24905	24910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185177
584	NC_021030	CGGT	2	8	24915	24922	0 %	25 %	50 %	25 %	479185177
585	NC_021030	CCA	2	6	24947	24952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185177
586	NC_021030	GAA	2	6	24986	24991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185177
587	NC_021030	TGC	2	6	25057	25062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185177
588	NC_021030	GGC	2	6	25081	25086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185177
589	NC_021030	GTT	2	6	25118	25123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185177
590	NC_021030	AGG	2	6	25251	25256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185177
591	NC_021030	CCT	2	6	25333	25338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185177
592	NC_021030	GTT	2	6	25364	25369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185177
593	NC_021030	GTT	2	6	25412	25417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185177
594	NC_021030	GAT	2	6	25424	25429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185177
595	NC_021030	GAA	2	6	25460	25465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185177
596	NC_021030	CG	3	6	25468	25473	0 %	0 %	50 %	50 %	479185177
597	NC_021030	CCT	2	6	25720	25725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185177
598	NC_021030	GAG	2	6	25773	25778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185177
599	NC_021030	CTC	2	6	25790	25795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185177
600	NC_021030	ACG	3	9	25797	25805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185177
601	NC_021030	CAC	2	6	25890	25895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185177
602	NC_021030	ACG	2	6	25981	25986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185177
603	NC_021030	CGG	3	9	26011	26019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185177
604	NC_021030	GAG	2	6	26067	26072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185177
605	NC_021030	GC	3	6	26081	26086	0 %	0 %	50 %	50 %	479185177
606	NC_021030	CGCCGT	2	12	26122	26133	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479185177
607	NC_021030	TAG	2	6	26157	26162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185177
608	NC_021030	TGC	2	6	26176	26181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185177
609	NC_021030	CGG	2	6	26188	26193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185177
610	NC_021030	GAT	2	6	26288	26293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185177
611	NC_021030	CGA	2	6	26309	26314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185177
612	NC_021030	CGA	2	6	26383	26388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185177
613	NC_021030	AGGAG	2	10	26449	26458	40 %	0 %	60 %	0 %	479185177
614	NC_021030	AGT	2	6	26653	26658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021030	GCC	2	6	26706	26711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_021030	GAGCGT	2	12	26762	26773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
617	NC_021030	TTG	2	6	26847	26852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_021030	CGG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021030	GTC	2	6	26897	26902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021030	CGA	2	6	26912	26917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021030	GAG	2	6	26951	26956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021030	CAAT	2	8	27011	27018	50 %	25 %	0 %	25 %	479185178
623	NC_021030	CGGG	2	8	27029	27036	0 %	0 %	75 %	25 %	479185178
624	NC_021030	GTC	2	6	27095	27100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185178
625	NC_021030	CAC	2	6	27135	27140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185178
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627	NC_021030	TCG	2	6	27204	27209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185178
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752	NC_021030	GCGT	2	8	32731	32738	0 %	25 %	50 %	25 %	479185180
753	NC_021030	GTC	2	6	32760	32765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185180
754	NC_021030	TCA	2	6	32804	32809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185180
755	NC_021030	TGT	2	6	32810	32815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185180
756	NC_021030	GAT	2	6	32817	32822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185180
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758	NC_021030	AT	4	8	33090	33097	50 %	50 %	0 %	0 %	479185180
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762	NC_021030	AGT	2	6	33346	33351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
763	NC_021030	T	6	6	33351	33356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
764	NC_021030	GGT	2	6	33359	33364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
765	NC_021030	TTC	2	6	33394	33399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
766	NC_021030	CGT	2	6	33460	33465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
767	NC_021030	CT	3	6	33525	33530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
768	NC_021030	CGG	2	6	33537	33542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_021030	TACG	2	8	33579	33586	25 %	25 %	25 %	25 %	479185181
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783	NC_021030	TGG	2	6	34031	34036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185181
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833	NC_021030	CCGCT	2	10	36596	36605	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
834	NC_021030	TCTG	2	8	36647	36654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
835	NC_021030	TGG	2	6	36712	36717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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839	NC_021030	GAA	2	6	36969	36974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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853	NC_021030	T	7	7	37683	37689	0 %	100 %	0 %	0 %	479185184
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861	NC_021030	CTCG	2	8	37837	37844	0 %	25 %	25 %	50 %	479185184
862	NC_021030	CGG	2	6	37921	37926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185184
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872	NC_021030	A	6	6	38639	38644	100 %	0 %	0 %	0 %	479185184
873	NC_021030	TCT	2	6	38684	38689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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876	NC_021030	GGA	2	6	38738	38743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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881	NC_021030	CAA	2	6	38950	38955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185185
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980	NC_021030	GAT	2	6	45288	45293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185187
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986	NC_021030	GGA	2	6	45464	45469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185187
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990	NC_021030	N	1114	1114	45739	46852	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
991	NC_021030	GAT	2	6	46865	46870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185188
992	NC_021030	GGA	2	6	46905	46910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185188
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994	NC_021030	GGA	2	6	47045	47050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185188
995	NC_021030	GTCGAA	2	12	47076	47087	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479185188
996	NC_021030	TTGA	2	8	47106	47113	25 %	50 %	25 %	0 %	479185188
997	NC_021030	GGA	2	6	47480	47485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185188
998	NC_021030	AAC	2	6	47536	47541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185188
999	NC_021030	GCA	3	9	47581	47589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185188
1000	NC_021030	TGAT	2	8	47656	47663	25 %	50 %	25 %	0 %	479185188

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